氨基酸作为构成蛋白质的基本单位，对于蛋白质的结构和功能至关重要，而其变化也与多种疾病的发生发展密切相关。尽管目前利用碱基编辑等技术1,2可以在基因组中实现碱基替换进而改变密码子，产生内源氨基酸的突变，但在全蛋白质组范围内对特定氨基酸残基进行系统性的功能分析仍然面临挑战。2023年11月22日，北京大学魏文胜团队在Molecular Cell杂志在线发表了题为“Unbiased interrogation of functional lysine residues in human proteome”的研究论文。该研究采用腺嘌呤碱基编辑工具，建立了一种在全蛋白质组范围内筛选功能性氨基酸位点的策略
2023年11月22日，昌平实验室/北京大学曹云龙课题组在《Nature》杂志上发表了题为“Repeated Omicron exposures override ancestral SARS-CoV-2 immune imprinting”的研究论文
2023年5月15日，昌平实验室、北京师范大学王晓群课题组、吴倩课题组，首都医科大学附属北京天坛医院王拥军课题组，与伦敦国王学院Oscar Marin课题组合作，在Cell Stem Cell杂志上发表了题为“The single-cell and spatial transcriptional landscape of human gastrulation and early brain development”的文章。
2023年4月13日，昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）张泽民教授受邀于Cell杂志发表了题为“Accelerating the understanding of cancer biology through the lens of genomics”的综述文章。
2023年4月11日，昌平实验室、北京大学生命科学学院、高宁团队在Cell期刊在线发表了题为“Structural basis of membrane skeleton organization in red blood cells”的研究论文。
2023年3月23日，肖俊宇研究组在Nature期刊在线发表了题为“Immunoglobulin M Perception by FcμR”的研究成果，揭示了FcμR识别不同形式IgM的分子机制。
2023年2月25日，昌平实验室、北大-清华生命科学联合中心、北京大学生命科学学院郭强研究团队在Advanced Science发表了题为“Cryo-Electron Tomography of Toxoplasma gondii Indicates That the Conoid Fiber May Be Derived from Microtubules”的研究论文。
2023年2月6日，昌平实验室、北京大学生命科学学院高宁研究团队与合作者于PLOS Biology在线发表了题为“Comprehensive structural characterization of the human AAA+ disaggregase CLPB in the apo- and substrate-bound states reveals a unique mode of action driven by oligomerization”的研究论文。
2023年2月3日，昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）曹云龙团队联合中国科学院生物物理研究所王祥喜研究团队在《柳叶刀-感染病学》（The Lancet Infectious Diseases）杂志在线发表题为“ACE2 binding and antibody evasion in enhanced transmissibility of XBB.1.5”的研究论文。
2023年1月18日，昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心刘河生研究团队在Science Advances发表题为“Robust dynamic brain coactivation states estimated in individuals”的研究论文。本研究基于“先验-解码”的思想，提出了一种“个性化的基于网络的单帧共激活模式估计”（INSCAPE）技术。
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